食品加工厂污水类似于动物屠宰废水，废水中含有血污、油脂、毛、肉屑、畜禽内脏杂物、未消化的食料和粪便等污染物质的废水，而且此类废水中还含有大量对人类健康造成危害的微生物。如不经处理直接排放，会对水环境造成严重危害，对人畜健康造成危害。肉类加工废水所含污染物质大多属于易生物降解的有机物，在它们排入水体后，会迅速的耗掉水中的溶解氧，造成鱼类和水生生物因缺氧而死亡；由于缺氧还会使水体转变为厌氧状态，这样会使水质恶化、产生臭味、影响卫生。同时，废水中的致病微生物会大量繁殖，危害人类健康。